Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Plcd4-202ENSMUST00000067916 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm5456-201ENSMUST00000170706 844 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm17045-201ENSMUST00000178600 844 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Zkscan5-202ENSMUST00000085671 3794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 4931423N10Rik-202ENSMUST00000114505 1392 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm15712-201ENSMUST00000120369 1156 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 AW822073-201ENSMUST00000075305 555 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hecw1Q8K4P8 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms