Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Aspa-206ENSMUST00000184572 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Ttc39d-202ENSMUST00000134652 2438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm15160-201ENSMUST00000120553 907 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Acrbp-201ENSMUST00000032481 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Olfr650-ps1-201ENSMUST00000121432 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SynpoQ8CC35 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms