Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm28653-201ENSMUST00000185494 5276 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Ctnnd1-217ENSMUST00000111691 5380 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Thbs1-201ENSMUST00000039559 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Inpp5d-210ENSMUST00000169754 4937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Chordc1-201ENSMUST00000001825 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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