Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Cherp-201ENSMUST00000079510 3713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm44014-201ENSMUST00000205150 1509 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Vipas39-201ENSMUST00000021426 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm44423-201ENSMUST00000203746 3158 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm44007-201ENSMUST00000203845 2189 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Dsg1bQ7TSF1 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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Dsg1bQ7TSF1 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Rbx1-ps-201ENSMUST00000173786 327 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm42889-201ENSMUST00000199480 660 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Zfp474-202ENSMUST00000209270 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Dsg1bQ7TSF1 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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Dsg1bQ7TSF1 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Dsg1bQ7TSF1 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
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Dsg1bQ7TSF1 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Siglech-202ENSMUST00000094360 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Dsg1bQ7TSF1 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Dsg1bQ7TSF1 Gm20745-201ENSMUST00000216827 3796 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Dsg1bQ7TSF1 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Dsg1bQ7TSF1 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
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Dsg1bQ7TSF1 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Dsg1bQ7TSF1 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms