Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm9142-201ENSMUST00000187161 955 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm29126-201ENSMUST00000188686 151 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm40040-201ENSMUST00000196123 504 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm42429-201ENSMUST00000198579 558 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm45549-201ENSMUST00000210180 975 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Tmem156-206ENSMUST00000212640 1271 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Spats1-201ENSMUST00000024731 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr901-201ENSMUST00000063716 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Grip1-215ENSMUST00000148954 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Vezt-203ENSMUST00000118205 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm37536-201ENSMUST00000194710 2491 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Rreb1-201ENSMUST00000037232 8395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm18637-201ENSMUST00000217665 1900 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Cpa5-203ENSMUST00000115139 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Srp72-201ENSMUST00000101087 3625 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Tpd52l2-208ENSMUST00000149163 3603 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gata4-203ENSMUST00000121312 2407 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Grip1-207ENSMUST00000130387 2780 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Pax3-202ENSMUST00000087086 3863 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 1700015F17Rik-201ENSMUST00000115447 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm24083-201ENSMUST00000175174 120 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm42573-201ENSMUST00000202327 478 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Zfp750-201ENSMUST00000092298 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm3269-201ENSMUST00000166025 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 CT025642.2-201ENSMUST00000225009 1649 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm20745-201ENSMUST00000216827 3796 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm3742-201ENSMUST00000220907 1391 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Nqo1-201ENSMUST00000003947 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Clcn1Q64347 Ezh1-202ENSMUST00000107284 4207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms