Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Ick-202ENSMUST00000044551 6560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Abca17-201ENSMUST00000039324 5202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm19340-201ENSMUST00000221995 345 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm24272-201ENSMUST00000102329 98 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Ccdc18Q640L5 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms