Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm12223-201ENSMUST00000135468 528 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm23598-201ENSMUST00000157262 144 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm22424-201ENSMUST00000158527 87 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Rnf141-210ENSMUST00000177462 859 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm25129-201ENSMUST00000082651 133 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm24542-201ENSMUST00000103870 110 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Aph1b-202ENSMUST00000113730 682 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm12746-201ENSMUST00000151369 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Sft2d1Q5SSN7 Gm20945-201ENSMUST00000178122 1145 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Sft2d1Q5SSN7 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Rpl22l1-206ENSMUST00000194649 525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Igkv8-22-201ENSMUST00000199501 367 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 E330011O21Rik-201ENSMUST00000209468 1107 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC160930.2-201ENSMUST00000226608 303 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Med6-201ENSMUST00000002756 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sft2d1Q5SSN7 C87499-201ENSMUST00000053304 1901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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