Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Kcne1-201ENSMUST00000051705 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Gtpbp6Q3U6U5 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Rrh-202ENSMUST00000171313 1759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12848-201ENSMUST00000119777 842 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Tmbim6-205ENSMUST00000160635 871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9146-201ENSMUST00000182254 1006 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9568-201ENSMUST00000182514 1008 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44148-201ENSMUST00000203718 316 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gtpbp6Q3U6U5 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gtpbp6Q3U6U5 Eif4e2-201ENSMUST00000050876 2869 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Sdr42e1-202ENSMUST00000173522 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Cd209c-201ENSMUST00000044060 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 CT010575.1-201ENSMUST00000220666 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Snx31-201ENSMUST00000013755 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Rab3il1-203ENSMUST00000121418 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 1300002E11Rik-201ENSMUST00000180830 3557 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Mindy4b-ps-202ENSMUST00000191233 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gtpbp6Q3U6U5 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36120-201ENSMUST00000214393 1734 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Gls-203ENSMUST00000114512 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Ddr2-201ENSMUST00000027985 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 A430078G23Rik-201ENSMUST00000098966 2945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gtpbp6Q3U6U5 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gtpbp6Q3U6U5 Rnu3b1-202ENSMUST00000200547 215 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gtpbp6Q3U6U5 AC133183.2-201ENSMUST00000221543 280 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms