Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Onecut2-201ENSMUST00000115145 13389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Traf3-202ENSMUST00000060274 6896 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm5446-201ENSMUST00000091762 784 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Fbxo7-204ENSMUST00000130320 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Tsc1-203ENSMUST00000113869 7702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Siah1bQ06985 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms