Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm20257-201ENSMUST00000185352 936 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm28285-204ENSMUST00000187793 601 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Pkia-203ENSMUST00000193330 631 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Rpsa-ps2-201ENSMUST00000059546 880 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Rpl31-ps20-201ENSMUST00000080982 378 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm1587-201ENSMUST00000100372 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm27401-201ENSMUST00000184052 173 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 1500002F19Rik-203ENSMUST00000211184 375 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Gjb2Q00977 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms