Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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SftpbP50405 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SftpbP50405 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SftpbP50405 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SftpbP50405 AC153793.1-201ENSMUST00000220956 1298 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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SftpbP50405 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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SftpbP50405 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SftpbP50405 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SftpbP50405 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SftpbP50405 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SftpbP50405 1700012E03Rik-201ENSMUST00000186237 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SftpbP50405 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SftpbP50405 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SftpbP50405 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SftpbP50405 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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SftpbP50405 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SftpbP50405 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SftpbP50405 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SftpbP50405 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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