Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Rps6-ps3-201ENSMUST00000118010 750 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm30808-201ENSMUST00000211166 845 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Tcf7l2-209ENSMUST00000111656 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 AF067063-202ENSMUST00000195234 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm31579-201ENSMUST00000203306 966 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 AC158535.1-201ENSMUST00000221487 769 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxc5P32043 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms