Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Cep162-201ENSMUST00000093802 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Akap2-205ENSMUST00000102903 6650 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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