Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm17995-201ENSMUST00000209266 530 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Olfr930-202ENSMUST00000217208 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Klra7-202ENSMUST00000049304 1075 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Hps1O08983 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Hps1O08983 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms