Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Pinlyp-201ENSMUST00000011776 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Cul1-203ENSMUST00000143941 530 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Mir7029-201ENSMUST00000184777 61 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm10416-201ENSMUST00000197379 645 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC142407.1-201ENSMUST00000214371 494 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm25442-201ENSMUST00000177270 92 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm44725-201ENSMUST00000205307 391 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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