Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Pik3cg-205ENSMUST00000217915 3340 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Gm28508-201ENSMUST00000188016 696 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm46342-201ENSMUST00000223411 602 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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Rabgef1Q9JM13 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
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