Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm2939-201ENSMUST00000198496 478 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Ceacam1-204ENSMUST00000205308 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm45295-201ENSMUST00000210393 1046 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 AC153937.2-202ENSMUST00000219583 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 4930473H19Rik-202ENSMUST00000222124 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Pramef20-201ENSMUST00000121109 1434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Crisp4-203ENSMUST00000115344 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm15355-201ENSMUST00000118929 285 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm24597-201ENSMUST00000122503 300 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 250 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm7442-201ENSMUST00000197778 383 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm30835-201ENSMUST00000198825 689 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm30052-201ENSMUST00000211951 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Cinp-205ENSMUST00000221182 774 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 AC113178.1-201ENSMUST00000227616 935 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Ccdc83Q9D4V3 Olfr1270-201ENSMUST00000099754 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Hus1-201ENSMUST00000020683 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Sycn-201ENSMUST00000119180 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms