Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm13196-201ENSMUST00000118297 379 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Slitrk2-202ENSMUST00000166241 7769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Slc2a9-203ENSMUST00000067886 3602 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 B3gnt2-201ENSMUST00000055549 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Eif4e-202ENSMUST00000196990 856 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm40348-201ENSMUST00000199648 452 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc71Q8VEG0 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms