Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm6993-201ENSMUST00000219110 210 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 AC124715.1-201ENSMUST00000228480 754 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ercc8Q8CFD5 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms