Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm2a-201ENSMUST00000000608 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Zswim9-202ENSMUST00000119139 3986 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm28955-201ENSMUST00000188167 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm44437-201ENSMUST00000203832 4038 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm43141-201ENSMUST00000199695 274 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm44902-201ENSMUST00000206177 805 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Slc26a1-201ENSMUST00000051757 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Cndp1-201ENSMUST00000070139 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm28846-201ENSMUST00000189161 368 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm32983-201ENSMUST00000208500 505 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Fmr1-206ENSMUST00000114657 4076 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 AC154597.1-201ENSMUST00000224095 2713 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms