Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 AC154141.1-201ENSMUST00000208403 4136 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm35521-201ENSMUST00000211285 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Zranb1-205ENSMUST00000215716 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
ChfrQ810L3 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms