Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 AC153564.1-201ENSMUST00000217771 3607 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Rian-209ENSMUST00000182406 3476 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5578-201ENSMUST00000121490 1236 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14353-201ENSMUST00000122200 869 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40552-201ENSMUST00000218233 1258 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ceacam14-201ENSMUST00000023953 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Ccdc88cQ6VGS5 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Ccdc88cQ6VGS5 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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