Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Efcab3-201ENSMUST00000021029 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 8030453O22Rik-202ENSMUST00000135363 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm7609-202ENSMUST00000113407 853 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Cd200r3-205ENSMUST00000114613 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm23852-201ENSMUST00000158376 77 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Gm17068-201ENSMUST00000163135 980 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Pdzk1ip1-207ENSMUST00000171877 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Pdzk1ip1-208ENSMUST00000177647 826 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm24269-201ENSMUST00000179216 77 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 1700113B19Rik-201ENSMUST00000191817 420 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Gm29154-249ENSMUST00000217020 847 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 AC153821.1-203ENSMUST00000218105 607 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm33684-201ENSMUST00000221119 263 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 CT009539.1-201ENSMUST00000226465 220 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Fam209-201ENSMUST00000029007 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Fgf2-202ENSMUST00000091203 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Rhox12-201ENSMUST00000096453 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Kbtbd4-202ENSMUST00000111464 2343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Ppwd1-201ENSMUST00000022226 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Msh4-205ENSMUST00000190449 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Slc7a13-201ENSMUST00000035890 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Nek10-203ENSMUST00000112631 3386 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Fam228a-204ENSMUST00000222363 2284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 A530064D06Rik-201ENSMUST00000027764 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Sulf1-203ENSMUST00000180062 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Asns-201ENSMUST00000031766 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Taf12-201ENSMUST00000030731 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm15169-202ENSMUST00000130794 2335 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Aqp9-201ENSMUST00000060917 2643 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Aqp9-202ENSMUST00000074465 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Hdlbp-201ENSMUST00000042498 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Abr-201ENSMUST00000065028 4444 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Mro-201ENSMUST00000119239 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Stmn2-201ENSMUST00000029002 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 L3mbtl3-202ENSMUST00000105519 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 1700024J04Rik-201ENSMUST00000093146 1821 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gpatch2-208ENSMUST00000160570 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Ccdc77-202ENSMUST00000112703 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm43465-201ENSMUST00000200367 2802 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm37842-201ENSMUST00000192330 1569 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm24938-201ENSMUST00000102225 110 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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