Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm14000-201ENSMUST00000118670 233 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms