Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC156645.1-201ENSMUST00000223066 5194 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gpm6b-202ENSMUST00000112223 4764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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