Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Tmem213-201ENSMUST00000031851 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Smim17-202ENSMUST00000160218 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm43122-201ENSMUST00000201752 354 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC8.34□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Traf3ip1Q149C2 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms