Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Fam135a-206ENSMUST00000187369 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Naalad2-201ENSMUST00000001826 2831 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 4930470B04Rik-201ENSMUST00000192005 1926 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Mns1-201ENSMUST00000034746 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Casr-201ENSMUST00000063597 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 5033421B08Rik-202ENSMUST00000219595 1194 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm12959-201ENSMUST00000119396 403 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Zfp677-202ENSMUST00000162659 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Gm37675-201ENSMUST00000192303 2847 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TrioQ0KL02 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms