Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Sec23a-204ENSMUST00000165134 2529 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Csf3r-202ENSMUST00000106162 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Napg-201ENSMUST00000025474 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm6639-201ENSMUST00000196349 429 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Klk1b12-ps-201ENSMUST00000206650 751 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Cblb-205ENSMUST00000227756 3378 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm43219-201ENSMUST00000197972 1937 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Olfr1510-202ENSMUST00000215928 1934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm3760-201ENSMUST00000167475 804 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm3047-202ENSMUST00000177998 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm8297-203ENSMUST00000178389 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm3460-202ENSMUST00000178927 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm21103-203ENSMUST00000179042 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm8159-203ENSMUST00000179231 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm3029-202ENSMUST00000179327 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Usp9xP70398 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms