Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm9585-201ENSMUST00000219681 1404 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm26512-201ENSMUST00000181874 3042 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Klra1-201ENSMUST00000032288 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms