Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm37446-201ENSMUST00000193015 4136 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Rbm28-201ENSMUST00000007993 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Phc1-201ENSMUST00000079560 3839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Ggt5-201ENSMUST00000072217 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm8362-201ENSMUST00000168790 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Tbc1d24-214ENSMUST00000201960 4305 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm21301-201ENSMUST00000189476 699 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Pard3b-203ENSMUST00000094906 7676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Eif4e2-207ENSMUST00000113235 3473 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Chd1P40201 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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