Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 2310005A03Rik-201ENSMUST00000142569 1398 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Dsc3-201ENSMUST00000115848 5333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm16050-201ENSMUST00000160626 2363 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Clca2-201ENSMUST00000040465 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Pilrb2-201ENSMUST00000164886 1807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gm37549-201ENSMUST00000194096 4065 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Hoxd9P28357 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm44812-201ENSMUST00000207627 5349 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Them7-201ENSMUST00000068813 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Nyap2-205ENSMUST00000137862 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 B230364G03Rik-201ENSMUST00000181479 1374 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Trav5-4-201ENSMUST00000103664 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Cd68-202ENSMUST00000108654 1008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Wfdc2-202ENSMUST00000109344 429 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm24748-201ENSMUST00000157836 108 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Phf11d-202ENSMUST00000160425 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm18779-201ENSMUST00000173444 577 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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Hoxd9P28357 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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Hoxd9P28357 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC159263.2-201ENSMUST00000221593 411 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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Hoxd9P28357 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Oard1-201ENSMUST00000046651 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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Hoxd9P28357 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 5330417C22Rik-201ENSMUST00000048012 3321 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm1988-201ENSMUST00000188190 2565 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC117656.3-203ENSMUST00000225007 1809 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 AC159379.2-201ENSMUST00000220244 2482 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Pkp4-203ENSMUST00000112577 4222 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm37258-201ENSMUST00000191734 1627 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Olfr117-203ENSMUST00000215414 3498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm43409-201ENSMUST00000195921 2162 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Lrrc9-203ENSMUST00000161284 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Ankrd45-202ENSMUST00000111608 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Pcdh15-225ENSMUST00000149977 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Ccdc36-201ENSMUST00000076592 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Gm28444-201ENSMUST00000190777 2137 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Hoxd9P28357 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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