Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Hsp90aa1-201ENSMUST00000021698 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gramd1b-204ENSMUST00000121357 7334 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm12121-201ENSMUST00000131630 500 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Tctex1d2-201ENSMUST00000014220 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm32496-201ENSMUST00000191988 702 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Spaca5-201ENSMUST00000040437 640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Plac8-202ENSMUST00000097437 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Pinlyp-201ENSMUST00000011776 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm14010-201ENSMUST00000131961 374 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 5730435O14Rik-202ENSMUST00000170047 617 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 Gm43008-201ENSMUST00000202346 286 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
VimP20152 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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