Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Ampd1-201ENSMUST00000090715 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm29446-201ENSMUST00000190887 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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H2-Eb1P04230 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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H2-Eb1P04230 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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H2-Eb1P04230 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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H2-Eb1P04230 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm43497-201ENSMUST00000201137 2316 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms