Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm44036-201ENSMUST00000204551 336 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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H2-M1F7CXU4 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
H2-M1F7CXU4 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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