Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm21818-202ENSMUST00000225144 894 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Npy-201ENSMUST00000031843 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Tcl1b1-201ENSMUST00000085043 1040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Rpl7a-ps8-201ENSMUST00000094754 801 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Mtfr1-203ENSMUST00000119865 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm4275-205ENSMUST00000212624 1436 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm25000-201ENSMUST00000117016 114 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm15627-201ENSMUST00000140421 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm16301-201ENSMUST00000161959 295 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 1700034B16Rik-201ENSMUST00000180957 722 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 1700100L14Rik-202ENSMUST00000189028 762 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm18857-201ENSMUST00000210421 901 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm45436-201ENSMUST00000210729 469 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
H2al1jA2BFR3 AC142227.1-201ENSMUST00000221371 621 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms