Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Muc2-201ENSMUST00000026590 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Add2-209ENSMUST00000204059 8182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Aasdh-201ENSMUST00000069709 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Slc2a9-210ENSMUST00000155634 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Tead1-206ENSMUST00000164363 1495 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Zfp229-201ENSMUST00000065871 4525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm16427-201ENSMUST00000179091 1449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Adgrf2-201ENSMUST00000113614 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ube3bQ9ES34 Igkv3-4-201ENSMUST00000103401 360 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ube3bQ9ES34 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ube3bQ9ES34 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ube3bQ9ES34 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ube3bQ9ES34 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ube3bQ9ES34 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Cep112-216ENSMUST00000182729 2850 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Ube3bQ9ES34 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Ube3bQ9ES34 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Lhfpl2-202ENSMUST00000118195 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Tcf23-201ENSMUST00000006818 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm13929-201ENSMUST00000117553 1125 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube3bQ9ES34 Rpain-211ENSMUST00000169965 343 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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