Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm26720-201ENSMUST00000181260 3538 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm12464-201ENSMUST00000121385 1016 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm23094-201ENSMUST00000157551 322 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm29354-201ENSMUST00000187613 696 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Tmem225-201ENSMUST00000046333 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Rnft1Q9DCN7 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms