Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.16
Ccdc97Q9DBT3 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm25232-201ENSMUST00000104502 132 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Efcab9-202ENSMUST00000109377 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm9392-201ENSMUST00000119337 554 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Scarna17-201ENSMUST00000158064 79 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm23259-201ENSMUST00000158318 303 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Milr1-208ENSMUST00000183111 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm28208-201ENSMUST00000185941 1157 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm29672-201ENSMUST00000187118 1038 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm28853-202ENSMUST00000188084 1157 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm28133-202ENSMUST00000191344 1158 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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Ccdc97Q9DBT3 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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Ccdc97Q9DBT3 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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Ccdc97Q9DBT3 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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Ccdc97Q9DBT3 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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Ccdc97Q9DBT3 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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Ccdc97Q9DBT3 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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