Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 CT033774.2-201ENSMUST00000222079 256 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 AC154767.1-201ENSMUST00000224669 358 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 AC165260.2-202ENSMUST00000224998 631 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Bcl2a1d-201ENSMUST00000098486 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm7364-201ENSMUST00000188760 1501 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Txndc16-204ENSMUST00000128484 2069 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm14419-201ENSMUST00000108975 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm15720-201ENSMUST00000117133 282 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm12464-201ENSMUST00000121385 1016 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm6871-204ENSMUST00000171059 462 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Ccdc83Q9D4V3 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Ccdc83Q9D4V3 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Ccdc83Q9D4V3 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 AC124736.1-201ENSMUST00000226382 419 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Klk1b11-201ENSMUST00000007156 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm20539-201ENSMUST00000174811 1384 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Rpsa-ps3-201ENSMUST00000117789 876 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm7831-201ENSMUST00000117990 552 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm13944-202ENSMUST00000146495 542 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm12746-201ENSMUST00000151369 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Uchl1os-202ENSMUST00000177319 505 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm20765-201ENSMUST00000177792 795 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm21312-201ENSMUST00000179258 795 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Ccdc83Q9D4V3 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms