Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm44621-201ENSMUST00000207643 1166 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Wfdc10-201ENSMUST00000094344 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Adamts12-201ENSMUST00000061318 8579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm6787-201ENSMUST00000123120 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 H60c-201ENSMUST00000170893 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Ect2-207ENSMUST00000176242 3985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Ccdc47Q9D024 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms