Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Nmnat2-201ENSMUST00000043313 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Phc1-201ENSMUST00000079560 3839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Olfr1232-203ENSMUST00000215679 2389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Aebp1-201ENSMUST00000102923 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Trim2-201ENSMUST00000054990 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Elp3-203ENSMUST00000225355 2771 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Snhg7os-202ENSMUST00000131841 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Tbc1d14-215ENSMUST00000146430 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Tdrd1-203ENSMUST00000111606 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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PtprtQ99M80 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Dusp27-202ENSMUST00000192369 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Fgf13-202ENSMUST00000119306 2091 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Cyp1a1-202ENSMUST00000216433 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Ankrd55-201ENSMUST00000022275 2412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Ttc30a1-201ENSMUST00000099994 3721 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Gpatch2-206ENSMUST00000160471 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PtprtQ99M80 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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