Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Ctnnd1-213ENSMUST00000111687 6030 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Igsf9b-204ENSMUST00000214357 16144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Usp47Q8BY87 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Usp47Q8BY87 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Polk-204ENSMUST00000221645 1644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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