Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Tmem106b-201ENSMUST00000031556 6002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Arhgef40Q3UPH7 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Arhgef40Q3UPH7 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm30132-201ENSMUST00000212816 8757 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Smarcal1-207ENSMUST00000152225 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Arhgef40Q3UPH7 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms