Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 AC154828.1-201ENSMUST00000220696 2810 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Q3U6N9 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 224.7 ms