Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm20274-201ENSMUST00000206967 584 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Musk-205ENSMUST00000102893 3323 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm37948-201ENSMUST00000192846 2169 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Vmn1r17-203ENSMUST00000228156 2090 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm23527-201ENSMUST00000104570 130 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm12243-201ENSMUST00000128521 821 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm17129-201ENSMUST00000168168 505 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm4668-201ENSMUST00000214742 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Usp39Q3TIX9 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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