Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC171003.1-201ENSMUST00000221667 1665 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Cntn5-204ENSMUST00000162484 3606 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AV064505-201ENSMUST00000124572 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 4930511E03Rik-201ENSMUST00000203778 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm5283-201ENSMUST00000177874 334 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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