Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Cd69-203ENSMUST00000204411 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm43618-201ENSMUST00000197392 3451 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Erg-202ENSMUST00000113846 3249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
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Traf3ip1Q149C2 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
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Traf3ip1Q149C2 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
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Traf3ip1Q149C2 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
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Traf3ip1Q149C2 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Anxa1-201ENSMUST00000025561 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
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Traf3ip1Q149C2 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
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Traf3ip1Q149C2 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
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Traf3ip1Q149C2 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm43664-201ENSMUST00000196038 734 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Traf3ip1Q149C2 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms