Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Eif4a2-202ENSMUST00000077605 2708 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm7910-201ENSMUST00000117896 835 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Olfr1449-202ENSMUST00000208624 1296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm18629-201ENSMUST00000222496 884 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Mir24-2-201ENSMUST00000083607 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Rapgef4-202ENSMUST00000090826 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 9230112J17Rik-201ENSMUST00000216749 2333 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cdx4Q07424 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms