Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Csf2rb-201ENSMUST00000096355 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Pnpla1-202ENSMUST00000114737 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Pnpla1-201ENSMUST00000056866 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Timeless-203ENSMUST00000105242 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Pus7-206ENSMUST00000148618 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Osgepl1-202ENSMUST00000114484 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Inpp4a-207ENSMUST00000136846 3576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gas8-203ENSMUST00000212923 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Zfp408-201ENSMUST00000099714 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Hapln3-203ENSMUST00000206092 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Rai14-202ENSMUST00000169385 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 4930433I11Rik-202ENSMUST00000206529 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm44233-201ENSMUST00000203616 226 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 AC113107.1-201ENSMUST00000218358 396 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 AC139381.1-201ENSMUST00000224215 478 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 1700009N14Rik-201ENSMUST00000029955 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Pkd2l2-201ENSMUST00000014647 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Lekr1-201ENSMUST00000099075 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Lmx1a-201ENSMUST00000028003 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Cd300e-201ENSMUST00000062787 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Itgbl1-201ENSMUST00000049681 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm1070-201ENSMUST00000114185 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Dgcr2-202ENSMUST00000066127 3790 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Supt5-201ENSMUST00000003527 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Pgm2-202ENSMUST00000102783 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm16050-201ENSMUST00000160626 2363 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Prpf31-201ENSMUST00000008517 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Ncald-201ENSMUST00000090150 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Aoc3-202ENSMUST00000103105 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Apba2P98084 Gm12804-201ENSMUST00000121030 999 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms