Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm13346-201ENSMUST00000135767 3634 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm25845-201ENSMUST00000122588 310 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Csnk2b-203ENSMUST00000173114 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 AC111092.1-201ENSMUST00000220181 411 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Rnf24-204ENSMUST00000165420 5833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm15079-201ENSMUST00000121943 216 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm3555-201ENSMUST00000160287 1395 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm10804-202ENSMUST00000162565 867 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm17122-201ENSMUST00000166047 372 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Irx1P81068 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms